財政部臺北國稅局表示，中小企業投資於研究發展之支出，得依中小企業發展條例第35條規定，在不超過當年度應納營利事業所得稅額30%限額內，得於支出金額15%限度內，抵減當年度應納營利事業所得稅額，或於支出金額10%限度內，抵減自當年度起3年內各年度應納營利事業所得稅額，擇一方式辦理；抵減方式一經擇定，不得變更。
該局說明，依中小企業發展條例授權訂定之中小企業研究發展支出適用投資抵減辦法規定，中小企業如欲申請適用上開研究發展支出投資抵減，其主體須為依法辦理「公司或有限合夥」登記並合於中小企業認定標準第2條所定基準之事業，且最近3年內無違反環境保護、勞工或食品安全衛生相關法律且情節重大者，並於辦理當年度營利事業所得稅結算申報期間開始前3個月起至申報期間截止日內，檢附相關文件向中央目的事業主管機關申請資格條件及當年度研究發展活動符合適用規定之認定。
該局進一步說明，以中小企業之會計年度屬曆年制者為例，113年度研究發展支出如欲適用投資抵減，應自114年2月起至5月底止申請研究發展活動認定；申請日之認定以申請文件送達中央目的事業主管機關之日為準；其郵遞者，應以掛號寄送，並以交郵當日之郵戳日期為準，逾期申請者，不予受理。另若有：(1)專為用於研究發展所購買或使用之專用技術；(2)專為用於研究發展所購買之專業性或特殊性資料庫、軟體程式及系統；(3)委託國外大專校院或研究機構研究，或聘請國外大專校院專任教師或研究機構研究人員之費用；(4)與國內外公司、大專校院或研究機構共同研究發展所為之支出，欲申請專案認定者，應併同研究發展活動認定之申請，向中央目的事業主管機關提出申請。
該局提醒，中小企業113年度研究發展支出如欲適用中小企業發展條例第35條規定之投資抵減，請於上開規定期限內，向中央目的事業主管機關提出研究發展活動及專案支出認定之申請，以免影響適用租稅優惠之權益。
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