財政部南區國稅局表示，外國營利事業在我國境內無固定營業場所及營業代理人者，其跨境銷售電子勞務所取得之我國來源收入，若屬所得稅法第88條規定扣繳範圍之所得，應由扣繳義務人於給付時，按給付額依規定之扣繳率扣繳稅款；境內買受人（即扣繳義務人）倘實際負擔我國來源收入應扣繳之稅款，得於給付外國營利事業勞務報酬前，向其所在地國稅局申請核定適用淨利率及境內利潤貢獻程度，並以我國來源收入依核定適用之淨利率及貢獻程度計算所得額，按規定之扣繳率扣繳稅款。
該局舉例，轄內甲公司透過在我國境內無固定營業場所及營業代理人之外國A公司架設之網站購買線上廣告，支付報酬新臺幣（下同）10萬元，甲公司依規定應按扣繳率20%扣繳稅款2萬元；如該公司與A公司約定，扣繳稅款由甲公司負擔，甲公司於給付前向南區國稅局申請該筆報酬按適用淨利率（假設為30%）及境內利潤貢獻程度（假設為50%）計算所得額，經該局核定後，甲公司應扣繳之稅款即為3,000元（10萬元×30%×50%×扣繳率20%）。
該局說明，前述扣繳義務人向其所在地國稅局申請核定境外電商適用之淨利率及境內利潤貢獻程度時，除填寫扣繳義務人專用的「外國營利事業跨境銷售電子勞務適用淨利率、利潤貢獻程度申請書」，並應檢附實際負擔我國來源收入應扣繳稅款之相關證明文件、合約、外國營利事業營業內容、境內外交易流程說明、主要營業項目證明文件及其他相關且必要證明文件，供國稅局核認。
該局提醒，扣繳義務人申請核定境外電商適用之淨利率及境內利潤貢獻程度前，可運用財政部稅務入口網「境外電商課稅專區/營利事業所得稅專區/核准淨利率及境內利潤貢獻程度名單查詢」項下，查詢外國營利事業（境外電商）跨境銷售電子勞務申請適用淨利率及境內利潤貢獻程度經同意公布適用結果核准名單，據以計算應扣繳之所得額及扣繳稅額；如查無案關交易電商之公告資料，再行備妥相關文件向所在地國稅局申請。
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