該局舉例說明，甲公司107年度辦理營利事業所得稅結算申報，列報全年課稅所得額為虧損600萬元，嗣經國稅局查獲短漏報所得額200萬元，加計該筆漏報之所得額後，全年所得額為虧損400萬元，雖無應納稅額，仍應依前揭規定，就其短漏報所得額200萬元，按107年度適用之營利事業所得稅稅率20%計算，其論處金額為40萬元（200萬元×20%），因甲公司於國稅局查獲後，坦承違章事實並願意繳清罰鍰，依稅務違章案件裁罰金額或倍數參考表規定，處以0.4倍罰鍰計16萬元（40萬元×0.4），但該筆罰鍰已超過上限金額9萬元，故甲公司最終應處罰鍰金額為9萬元。
該局籲請營利事業，應誠實辦理營利事業所得稅結算申報，倘因疏失而有漏報所得額情事者，應儘速依稅捐稽徵法第48條之1規定，自動向國稅局補報並補繳稅款，以免被查獲短漏報所得額而遭處罰。
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