該局說明，依財政部75年11月19日台財稅第7568163號函規定，建設公司與地主簽訂合作建屋契約，雖約定建主因合建而換入之土地，其土地增值稅由建主負擔，惟土地增值稅依照土地稅法規定應由賣方（地主）負擔，故該土地增值稅不得列入建主之費用或建屋之成本。
該局舉例說明，甲建設公司107年度與地主合建分屋，依雙方所簽訂之合作建屋契約，甲建設公司須就換入之土地負擔繳納土地增值稅300萬餘元，因該土地增值稅依照土地稅法規定應由地主負擔，依上開財政部75年函釋規定，不得列入甲建設公司之費用或建屋之成本。
該局特別強調，營利事業如有因合建而換入之土地，依約須由建商負擔繳納換入土地之土地增值稅，依前述規定不得列為成本費用，籲請營利事業應注意稅法相關規定，以免遭調整補稅。
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