該局說明，蔡先生設立的商號如屬小規模之獨資、合夥組織營利事業，無須辦理營利事業所得稅結算申報，由稽徵機關按查定課徵營業稅之營業額核定其營利事業所得額，直接歸併獨資資本主或合夥組織合夥人之營利所得，納稅人亦可依稽徵機關所提供查詢該營利所得之資料，合併申報個人綜合所得稅。若非屬小規模之獨資、合夥組織營利事業，因所得稅制優化方案之實施，自107年度起，只須辦理營利事業所得稅結算申報，無須計算及繳納其應納之結算稅額，其營利事業所得額列入獨資資本主或合夥人個人綜合所得稅之營利所得，課徵綜合所得稅。
該局進一步提醒，非屬小規模營利事業獨資資本主或合夥人取自其經營事業盈餘之營利所得，並非經由稽徵機關核算，故不在稽徵機關提供結算申報期間查詢所得資料之範圍內，應自行依營利事業所得稅結算申報書之損益及稅額計算表之課稅所得額，於綜合所得稅結算申報時列報為營利所得，以免遭補稅及處罰。
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