財政部北區國稅局說明，營利事業如有所得稅法第4條之1及第4條之2規定停徵之證券及期貨交易所得者，依所得基本稅額條例第7條第1項第1款規定應計入基本所得額計算，惟出售持有滿3年以上屬所得稅法第4條之1規定之股票者，其所得自102年起，得減半課稅。
該局進一步說明，依所得基本稅額條例第7條第3項規定，營利事業於102年度以後出售其持有滿3年以上屬所得稅法第4條之1規定之股票者，於計算其當年度證券交易所得時，減除其當年度出售該持有滿3年以上股票之交易損失，餘額為正者，以餘額半數計入當年度證券交易所得。故減半計算之規定僅適用於出售持有滿3年之股票，出售持有滿3年以上之基金所得不納入減半計算範圍。
該局舉例說明，甲公司103年度出售持有滿3年以上之「股票」交易所得及損失分別為400萬元及80萬元，持有滿3年以上之「基金」交易所得為120萬元，持有未滿3年「股票」之交易所得為180萬元。公司申報計入基本所得額之證?交易所得金額為400萬元【(400-80+120)/2+180】，惟買賣基金所得不適用減半計算之規定，核定基本所得額為460萬元【(400-80)/2+120+180】，遭補稅處罰。
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