北區國稅局表示，為改善所得分配及增加國庫稅收，自104年1月1日起，依所得稅法第66條之6第1項但書規定，我國兩稅合一制由「完全設算扣抵制」修正為「部分設算扣抵制」，我國境內居住之個人股東獲配之股利淨額或盈餘淨額，其可扣抵稅額為原可扣抵稅額之半數，其餘半數則不得分配扣抵。
 　　因此，營利事業若有同法第114條之2規定超額分配可扣抵稅額情事者，依財政部104年12月30日台財稅字第10404030450號令規定，稽徵機關應以股利（或盈餘）淨額依稅額扣抵比率計算金額之半數與實際分配可扣抵稅額之差額，計算超額分配應補稅額及裁罰基準。
 　　該局舉例說明，甲公司於104年5月29日召開股東會並決議分配屬103年度之股利淨額800萬元，該公司股東均為中華民國境內居住之個人，依據所得稅法第66條之6規定計算適用之稅額扣抵比率為12%，故可分配予股東之可扣抵稅額為48萬元（800萬元×12%×1/2）。惟該公司因計算錯誤，申報稅額扣抵比率為18%，致實際分配予股東之可扣抵稅額為72萬元（800萬元×18%×1/2），則計算甲公司超額分配可扣抵稅額應補繳之稅額及裁罰基準為24萬元（72萬元－48萬元）。
 　　北區國稅局提醒，兩稅合一股東可扣抵稅額減半新制實施後，營利事業如有超額分配可扣抵稅額之情形，自動依稅捐稽徵法第48條之1規定，向稅捐稽徵機關補報並補繳超額分配稅款者，亦應依上開規定計算應補繳稅款，並得於補繳日計入股東可扣抵稅額帳戶；經核定超額分配應補繳稅額，於實際繳納日亦可計入股東可扣抵稅額帳戶。
      營利事業如仍有不明瞭之處，請至該局網站（網址為http://www.ntbna.gov.tw）查詢相關法令，或利用該局免費服務電話0800-000321洽詢，該局將竭誠提供詳細之諮詢服務。
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