南區國稅局表示，營利事業屬公司組織者，應採權責發生制。所謂權責發生制係指收益於確定應收時，費用於確定應付時，即行入帳。亦即在權責發生制下之收入(或支出)客體已實現，雖不以現實取得或付出為必要，取得債權或負擔債務亦在其列，然而該債權及債務至少應以「確定發生」者為限。
該局說明，甲公司98年度營利事業所得稅結算申報，列報其他損失5,500萬餘元。經國稅局查核結果，以其中5,200萬餘元損失尚未實現，乃否准認列，核定其他損失300萬餘元。甲公司不服，主張其97年度將承攬乙公司之A工程估列物價指數調整款5,200萬餘元列報其他收入，嗣98年度因客觀條件不存在而沖轉列為其他損失，該損失並非無法確知為由，循序提起行政訴訟，經行政法院判決甲公司敗訴。
行政法院判決理由指出，甲公司與乙公司因A工程之工期逾期原因，導致後續末期工程款項估驗及繳交逾期罰款有所爭議，甲公司已於99年間向臺灣○○地方法院提起民事訴訟，請求乙公司給付1億餘元（含物價指數調整款5,200萬餘元），目前尚未經民事法院判決確定，甲公司究竟能請求之金額為何，且其損失為何，於民事法院判決確定前，尚無法確知，甲公司自應待法院判決確定後，再依營利事業所得稅查核準則第64條規定，以過期費用或損失列報，乃判決甲公司敗訴。
該局提醒，營利事業會計基礎採權責發生制者，應注意列報其他損失時應已確定實現者為限，以免遭剔除補稅。
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